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TMT標記定量蛋白質組學研究案例：2021年12月威爾康奈爾醫(yī)學中心和紀念斯隆凱特琳**中心的Linda T. Vahdat 和 Vivek Mittal教授課題組在Nature Communications期刊發(fā)表的題為 “Copper depletion ...

為了更好地了解DON對C2C12細胞分化的影響，作者進行了轉錄組學和蛋白質組學的整合分析。共鑒定了149個共同的***差異基因（co-DEG），其中91%被共下調（圖3A）。15%的co-DEG屬于真核細胞骨架，其中大部分屬于肌動蛋白絲，少數(shù)是中間絲和微管的成...

蛋白質組學(由鹿明生物提供技術支持)；2021年8月，中國醫(yī)學科學院基礎醫(yī)學研究所趙春華和韓欽課題組在Aging and disease期刊發(fā)表了題為“MSC-derived Exosomes can Enhance the Angiogenesis of H...

空間代謝組學：中文標題：糞便宏基因組和血清代謝組的整合分析揭示腸道微生物組相關代謝物在結直腸*和腺瘤檢測的作用研究對象：人糞便、血清、組織發(fā)表期刊：Gut影響因子：23.059發(fā)表時間：2021年8月發(fā)表單位：國家**中心中國醫(yī)學院科學院**醫(yī)院運用生物技術：...

4D蛋白質組學分析發(fā)現(xiàn)，不同的病因和疾病的嚴重程度中蛋白表達存在差異。嚴重的疾病同急性期的蛋白的增加，補體系統(tǒng)蛋白及功能相關的蛋白相關；通過COVID-19和健康組對比，發(fā)現(xiàn)了49%的差異分析物；和膿毒癥相比，G-CSF，IL-8等在嚴重的COVID-19患者...

酵母單雜交篩選技術:關于HIV想必大家都不陌生，***HIV病毒后潛伏周期長，且目前沒有完全的***方法。為了徹底***HIV，不讓其發(fā)病就要從2方面入手：要么消除潛伏***的細胞，要么防止?jié)摲《镜募毎?**。也就是需要抑制HIV病毒的轉錄。但是關于HI...

結果表明，原*基因MYC與SERBP蛋白共同調節(jié)**生長所必需的脂肪生成，MYC誘導SREBP1，然后二者共同***脂肪酸合成并利用葡萄糖和谷氨酰胺促進脂肪鏈的延伸。小鹿推薦通過空間代謝組學技術，能夠觀察到MYC誘導后不同**的體內脂質組學變化，準確地繪制MY...

iTRAQ標記定量蛋白組學技術研究方法：2021年7月，海南大學園藝園林學院吳友根教授課題組等在《Horticulture Research》期刊發(fā)表了題為“Integrative iTRAQ-based proteomic and transcriptomi...

利用酵母文庫進行雙雜交篩選，結果顯示 MdBT2 可以與 MdRGL3a 結合。MdRGL3a 編碼 GA 信號阻遏物 DELLA 蛋白，主要分布于細胞核中。MdRGL3a 對于 GA 處理非常敏感，可以引起其發(fā)生降解，PAC 處理可以提高其穩(wěn)定性。進一步的酵...

本篇為2021年8月，國家**中心中國醫(yī)學院科學院**醫(yī)院崔巍研究員與專業(yè)多組學技術團隊合作在醫(yī)學一區(qū)消化道領域國際期刊《GUT》期刊發(fā)表了題的研究成果，通過非靶向代謝組、靶向代謝組以及AFADESI-MSI空間代謝組學(研究方法，整合了宏基因組的數(shù)據(jù)，發(fā)現(xiàn)了...

DIA蛋白組學：SAPHO綜合征是一種侵犯皮膚和骨骼的炎癥性疾病，其發(fā)病率低，表現(xiàn)形式多樣，診斷困難。2022年1月，由北京中醫(yī)藥大學課題組在J Proteomics.期刊發(fā)表的題為“Complement system deregulation in SAPH...

AFADESI-MSI空間代謝組學：1、已落地執(zhí)行項目100+，其中包括藥物在組織中的分布、多種疾病類型和不同處理手段下組織中代謝物的空間成像檢測。2、檢測組織樣本類型20+。高準性的定性算法通過物質表達空間情況、加和離子及同位素峰表達強度相似性、同位素表達空...

酵母文庫實驗本研究鑒定了一個可以與MdMYB9相互作用的蛋白MdTRB1。實驗表明，MdTRB1可以正向調節(jié)花青素和原花青素的累積。MdTRB1與MdMYB9結合可以增強后者對下游基因的轉錄***活性。而MdTRB1與MdJAZ1的結合，可以干擾其與MdMYB...

進行了酵母雙雜交文庫的篩選，結果顯示鈣依賴的種子特異性蛋白激酶SPK可以與OsNF-YB9相互作用，分段截取互作驗證顯示OsNF-YB9的N端是互作所必須的（圖a-b），并通過雙熒光分子互補實驗、BiFC、體外GST-pulldown實驗得以證實（圖c-e）。...

酵母雙雜交表明擬南芥AtBT2蛋白可以與AtRGA互作。與對照相比，擬南芥bt1/2雙突變體幼苗高度降低，而硝酸鹽處理可以進一步抑制其生長，外源施加GA可以回復其生長缺陷。在擬南芥中異源表達MdBT2可以明顯提高植株高度，而PAC處理則會抑制這種生長的促進作用...

空間代謝組學：在大鼠腦繪制特定區(qū)域分布的極性代謝物圖譜使用AFADESI-MSI在正離子和負離子模式下分別獲得298個和372個微區(qū)輪廓清晰的代謝物離子圖像。使用精確分子量并結合同位素豐度，通過人類代謝組數(shù)據(jù)庫（HMDB）對離子圖像進行識別，鑒定出多種內源極性...

歐易酵母文庫助力小麥根研究,本研究克隆了小麥的 ERFs 轉錄因子家族 1 個成員 TaSRL1，它可以調控生長素生物合成、轉運和信號轉到相關基因的表達，并與生長素轉運基因 TaPIN2 啟動子序列結合促進其表達，進而抑制根的生長。此外，TaSRL1 可以與 ...

質譜成像（Mass Spectrometry Imaging, MSI）作為一種新型的分子影像技術，能夠直接從生物組織中獲得大量已知或未知的內源性代謝物和外源***物等分子的結構、含量和空間分布信息。相對于其他成像方法（如熒光成像、放射性標記成像等），該技術無...

酵母文庫：近日，上海市農業(yè)科學院作物育種栽培研究所儲黃偉副研究員、曹黎明研究員為共同通訊作者，在Plant，Cell&Environment雜志（IF：7.228）在線發(fā)表了題為“Aconservedclathrin-coatedvesiclecomponen...

基于原位測序的空間轉錄組技術。基于原位測序（ISS）的方法通過測序產生空間轉錄組信息，這種方法只依靠連接酶連接兩段DNA—一段已知序列的引物和一個探針與模板匹配，不匹配的探針就會被洗掉。2013年開發(fā)的ISS中，每個探針使用一個查詢堿基來測序基因條形碼。FIS...

美國腦計劃啟動的 BICCN 項目，該項目將整合不同類型細胞的分子、解剖學和生理學特性，創(chuàng)建小鼠腦細胞 3D 參考圖譜，同時也將基于人類和非人類靈長類腦組織樣本，繪制腦細胞參考圖譜 ，其涉及空間轉錄組學技術主要包括 MERFISH 和 seqFISH。一些實現(xiàn)...

單細胞轉錄組分析的另一應用領域是發(fā)現(xiàn)亞細胞成分的基因表達譜，例如對在神經元的軸突或樹突部分特異表達的基因的轉錄組的分析，這些基因往往對細胞的生物學功能發(fā)揮著重要作用。但是，鑒于目前的技術手段，單細胞轉錄組測序仍然存在覆蓋率低的弊端，導致除mRNA以 外的長非編...

單細胞技術已經應用于研究機體各個***和組織的發(fā)育和疾病機理。目前大家關注較多的是單細胞轉錄組學，單細胞層面多組學，如基因組、表觀組、蛋白組和代謝組等目前還存在一定的瓶頸，未來技術和設備的升級，勢必會擴大單細胞技術的應用范圍。單細胞測序也是實現(xiàn)精細醫(yī)療的重要工...

單細胞生物學**近幾年是非常熱門的研究方向。在這一領域中，**前沿的則是單細胞測序技術。傳統(tǒng)測序方法一次處理成千上萬個細胞，得到的變異水平也是成千上萬個細胞的平均后水平。但是，就如同世界上沒有完全相同的兩片樹葉一樣，沒有兩個細胞是完全相同的。所以，單細胞測序對...

歐易生物單細胞測序近期高分文章不斷，在接下來的幾篇單細胞文獻解讀軟文里，我們將為大家持續(xù)送上近期合作發(fā)表的單細胞文獻解讀。本篇文章為大家解讀今年5月由上海交通大學附屬上海市第一人民醫(yī)院劉堃團隊在Diabetes(IF9.461)期刊發(fā)表的關于2型糖尿病小鼠...

歐易生物是國內早期開展單細胞測序分析的公司之一。目前擁有10x Genomics及BD Rhapsody兩個單細胞測序平臺，以及完整、系統(tǒng)的生物信息學分析技術和流程。除了能夠進行常規(guī)的scRNA-seq（single-cell RNA sequencing），...

歐易生物是國內少數(shù)具備10×Genomics和BD RhapsodyTM單細胞測序雙平臺的機構之一，在醫(yī)學和農林方向提供專業(yè)的單細胞建庫測序及分析服務，包括5’端和3’端基因表達分析、免疫組庫分析（TCR/BCR）、ATAC分析和表面蛋白分析等。歐易生物單...

（2）基因檢出率低當前主流的單細胞平臺對基因的捕獲效率較低，常見的臨床標本，可檢測到的基因中位值在1-5k不等，占總基因數(shù)的10-20%。低豐度的基因往往捕獲不到。 （3）測序數(shù)據(jù)的高背景單細胞測序數(shù)據(jù)的背景噪聲大。單個細胞RNA含量很少，擴增和捕獲...

單細胞技術就是以單個細胞為單位，研究單個細胞的基因組或轉錄組，提供細胞間變異的高分辨視圖。探索復雜組織中單個細胞的不同生物學特性，了解細胞亞群對環(huán)境因素的反應，有助于研究細胞功能，細胞分化，增殖和**發(fā)生的機制。正式由于其在生命科學研究中的發(fā)揮了重要作用，目...

單細胞測序并非**對一個細胞進行測序，而是對單一細胞的轉錄組進行捕獲和檢測，可以理解為單細胞水平上的測序，能同時測序成千上萬個細胞。單細胞測序技術的出現(xiàn)和應用，能夠完全反映組織里不同細胞群體的異質性信息，幫助獲得許多嶄新的科研見解，帶領生物學研究進入了一個新次...